研究人员开发了用于病毒发现的序列分析管道

赫尔辛基大学的研究人员开发了一种新型的生物信息学管道，称为Lazypipe，用于识别宿主相关或环境样品中的病毒。

该管道是在病毒学家和生物信息学家之间密切合​​作下开发的。研究人员认为，他们已经成功解决了病毒宏基因组学通常遇到的许多挑战。

此前，由Olli Vapalahti教授领导的病毒人畜共患病研究小组已经发表了两个实例，这些实例是由Lazypipe从野生动物中鉴定出的新型和潜在的人畜共患性病毒媒介物，可以用作载体。从肯尼亚的Mops condylurus蝙蝠的粪便和器官样本中鉴定出一种新的埃博拉病毒，并从东北部的tick中鉴定出一种新的由tick传播的病原体阿里山病毒。

Teemu Smura博士说：“这些例子证明了Lazypipe数据分析对具有非常不同的DNA / RNA背景的NGS文库的有效性，涉及从哺乳动物组织到合并和压碎的节肢动物。

Covid-19增加了快速检测新病毒的需求

当前的大流行增加了以无偏见的方式快速检测以前未知的病毒的需求。

Ravi Kant博士说：“在没有参考基因组的情况下检测到SARS-CoV-2，证明了Lazypipe可用于出现新型人畜共患病毒的药物，并可通过NGS测序从临床样品中快速检测出来。”

4月初，研究小组使用Lazypipe测试了SARS-CoV-2阳性样本的文库。

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