用于直接测量肿瘤的计算方法表明超转录在癌症中普遍存在

来自多伦多大学、多伦多病童医院、安大略省癌症研究所、乔治敦大学和纪念斯隆凯特琳癌症中心的一组研究人员使用一种计算方法直接测量肿瘤，表明超转录在各个领域无处不在癌症。

在他们发表在《科学进展》杂志上的论文中，该小组描述了开发一种新的计算工具来测量肿瘤中所有基因的转录水平，然后用它来了解更多关于超转录对癌症患者生存能力的影响。

先前的研究表明，RNA 是在称为转录的过程中从 DNA 合成的，从而产生基因产物，例如蛋白质。先前的研究还表明，随着肿瘤开始生长，转录通常也会出错，从而导致超转录。

一段时间以来，医学研究人员一直想知道肿瘤中的部分或全部细胞是否具有转录改变，但由于技术挑战一直未能找到答案。

在这项新的努力中，研究人员通过开发一种名为 RNAmp 的新工具克服了这些技术挑战。当对肿瘤突变数据、肿瘤类型和染色体结构变化等其他数据进行训练时，它会返回整个肿瘤的标准化 RNA 测量值。

有了他们的新工具，研究人员开始着手回答超转录是仅发生在选定细胞中还是发生在整个肿瘤的所有细胞中的问题。他们研究了涵盖 31 种癌症的 7,494 种肿瘤的转录水平，发现超转录普遍存在于给定肿瘤中，无论其类型如何。他们发现，在他们测试的所有肿瘤中，转录水平普遍较高。

研究人员还发现，超转录的程度可能与生存能力有关——更高水平的转录与更短的生存时间直接相关。研究人员无法找到相关性的原因，但指出在诊断患者时使用他们的新工具可以为患者提供更准确的生存时间框架估计。

从更积极的角度来看，这一新发现表明，未来专注于减少肿瘤超转录的研究可能会带来更好的结果。

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