由卓越集群 PMI 的研究人员领导的一个国际团队发现了在抗 TNF α 治疗开始时表明其是否有效的生物标志物。

对于克罗恩病和溃疡性结肠炎等慢性炎症性肠病 (IBD) ，免疫反应紊乱会导致胃肠道炎症，这种炎症一次又一次地发作。IBD 患者患有慢性腹泻、发烧和疼痛，他们的生活质量严重受损。

在德国，约有 320,000 人受到影响。IBD 的既定疗法是用抗体治疗，抗体与免疫系统的那些化学信使结合，这些化学信使会促进炎症，从而阻止它们的运作。这组所谓的生物制品还包括 TNF-α 抗体(anti-TNF-α)。

然而，大约 40% 的患者对这些生物制品没有反应。此外，可能会出现严重的副作用。来自“慢性炎症精准医学”(PMI)卓越集群的研究人员发现了分子生物学标志物，可以在治疗开始时用于确定抗 TNF-α 治疗是否有效。他们最近与国际同事一起在Genome Medicine上发表了他们的发现。

改变基因活性作为治疗成功的标志

在他们的研究中，由基尔大学 (CAU) 临床分子生物学研究所 (IKMB) 主任 Philip Rosenstiel 教授和石勒苏益格-荷尔斯泰因大学医学中心内科 I 系主任 Stefan Schreiber 教授领导的团队(UKSH) 和 IKMB 分析了接受抗 TNF-α 抗体治疗的 IBD 患者的血液，包括在治疗开始前和治疗开始后的不同时间。

使用最先进的测序和分析方法，他们一方面研究基因表达，即哪些基因在细胞中活跃，活跃程度如何，另一方面是 DNA 甲基化，这是对细胞的化学修饰。对基因活性也有影响的遗传物质，通常会保留更长时间。

“治疗开始两周后，我们能够检测到基因表达和甲基化模式的显着变化，这特别只发生在所谓的反应者中，即后来对治疗有反应的患者，”第一个解释说该出版物的作者 Neha Mishra 博士是 IKMB 的生物信息学家和卓越集群 PMI 的成员。在此时没有表现出这种模式的患者中，治疗随后也没有成功。

“然后，我们使用第二个独立的患者队列验证了分析——使获得的数据高度可靠，”米什拉说。研究小组发现了大约 4,000 个基因，这些基因在响应者中表现出改变的活性。在临床实践中，对患者血液样本中所有这些基因进行检测既费时又昂贵。

因此，研究人员已经确定了其中的基因组，总共包含大约 50 个基因，这些基因特别适合作为生物标志物，即作为可以在临床实践中预测治疗反应的值。

“我们的研究结果是迈向真正的精准医疗方法治疗 IBD 患者的第一步。这些生物标志物旨在使医生能够在未来对靶向治疗做出基于个体的、基于分子的决定，”Rosenstiel 说。

“这将使那些无法接受抗 TNF-α 治疗的患者尽早停止治疗，从而避免不必要的副作用，并能够更快地找到适合他们的治疗方法。它还可以节省医疗系统不必要的负担成本，”Rosenstiel 补充道。

已经在临床试验中

这种方法已经在位于基尔的 UKSH 的炎症医学综合中心 (CCIM) 进行初步临床测试。“最近，作为一项研究的一部分，我们在开始治疗两周后开始测试我们用 TNF-α 抗体治疗的患者的这些基因活性模式。我们在跨学科的基础上讨论结果，并共同决定是否根据PMI 发言人 Stefan Schreiber 教授解释说，在现有数据中，治疗仍然是合适的，应该继续。

“因此，我们的患者已经直接受益于卓越集群 PMI 进行的最新研究结果。同时，我们可以使用这种方法在实践中研究新的生物标志物，从而优化分析方法。这样它就有望在未来用于常规临床环境中，”Schreiber 补充道。